萬歷皇帝雖然駕崩的時候只有56歲，但是他卻是大明一朝在位時間最長的皇帝，其在位時間為48年，萬歷前中期由于有張居正等大臣的大力輔佐，所以迎來了“萬歷中興”的局面，但是在后期卻因為墮落腐化使得明朝開始走向下坡路，其在死后與他的皇后一同被葬入了定陵。

本來人死之后就不應該被后人打擾，但是連同定陵在內的明十三陵可是在后來屢次被人打擾，先是由闖王李自成的農民軍破壞，接著清軍入關的時候又對這些前朝陵墓造成了一定毀壞，接著到了民國時期這些明朝陵墓的地面建筑又被毀壞殆盡，最終到了1956年一些考古學家主動對定陵進行了發掘，而萬歷皇帝的尸骨和一些陪葬珍品就在這次發掘過程中遭遇到了重大損毀

萬歷皇帝的棺材更是在那個動亂的年代里被人扔到了山溝，至于尸骨則是被架在柴火堆上給燒了個一干二凈，以至于醫學技術工作者僅僅只對萬歷皇帝的尸骨做了一些簡單化驗就被迫中斷了。雖然得出了萬歷皇帝是一個跛腳皇帝以及牙齒得過蛀牙的情況，但是對于其是到底是因為吸食鴉片而死還是因為身患梅毒而死卻還還未來得及化驗

當時一些史學家例如郭沫若等人緊跟著提出了發掘明長陵的申請，但是被周總理嚴肅拒絕。所以以后我們再也不主動發掘帝王陵了，除非是無意中被發現需要進行搶救性開挖保護