捻軍（1853年——1868年）是一個活躍在長江以北皖、蘇、魯、豫四省部分地區的反清農民武裝勢力，與太平天國同時期。捻軍起義從1853年至1868年，長達十五年。“捻”是淮北方言，意思是“一股一伙”，捻軍起源于“捻子”，最初安徽、河南一帶有游民捏紙，將油脂點燃，燒油捻紙用來作法，于節日時聚眾表演，為人驅除疾病、災難以牟利。越是荒年歉收，入捻人數越多，所謂“居者為民，出者為捻”，而清朝官方稱之為捻匪。

其實捻軍的形成也是受了太平軍的影響的，1853年，太平軍連克武漢、安慶、南京，安徽、河南，經安徽、河南時，皖北捻子紛紛響應，饑民四處揭竿而起。每年秋季集合外出奪糧。捻眾紛紛起義響應。及至太平天國北伐軍經過時，已經從分散斗爭趨向聯合作戰。1855年，黃河決口，魯南、皖北、蘇北大批災民無家可歸無糧可食，也紛紛加入捻軍，至此捻軍已成氣候并達到了高潮。1857年春，捻軍渡淮河南征，與太平天國會師正陽關。從此以聽分封不聽調用為條件，接受太平天國領導，配合太平軍作戰，但不接受改編。年底，內部出現分歧，以藍旗將領劉永敬為首的部分捻軍堅持要回淮北，捻軍于是分裂，大部分返回淮北，只有少數留在淮南，與太平天國保持著較密切的關系。還有一部分轉戰南北，曾深入河南、山東，推動了當地人民以各種形式起義反清。在皖北、蘇北，捻軍協同太平軍或獨立作戰，屢破清軍。1864年6月，太平天國失敗后余部太平軍和捻軍合并為聯軍。以太平軍軍制重新整編，重組捻軍，新捻軍采用靈活機動的戰術，易步為騎，奔馳豫、魯、蘇之間，聲勢復振。逐漸變為一支約十萬余人的騎兵部隊。

1865年5月，捻軍在山東曹州埋伏，全殲窮追不舍的僧格林沁所部，華北震動，燕京戒嚴。京師令曾國藩剿捻。曾改追擊為四鎮堵剿，但捻軍突破湘軍、淮軍的包圍，進入湖北。曾國藩因圍剿不力被清廷撤免欽差大臣，李鴻章繼其任。1867年初，捻軍轉戰陜西后，經山西洪洞向南入河南濟源，再向東北挺進河北，至保定，威脅北京。最后進入山東黃河以北、運河以東地區，后被李鴻章淮軍圍困于黃河南岸、運河東岸、膠萊河西岸和六塘河北岸的地區內，突圍失敗，主力覆沒余部于次年1月在江蘇揚州覆沒，至此，捻軍起義失敗。

“流寇式”的農民起義，其破壞生產，脫離群眾，使得長期的擄掠讓士卒們失去遠大理想，只為填飽肚子而戰，失去了農民起義的正當性與進步性，失敗也就成了必然。