清承明之后，福建私家藏書又有了重大的發展，無論在藏書的規模、數量、種類、區域分布等方面，均超過了以往的任何一個朝代，達到了古代福建私家藏書的鼎盛時期。其中，有文獻記載的清代福建藏書家多達170余人，藏書樓（室、齋）有100余座。
清代福建私家藏書，大致可分為以下三個階段：
清初福建是重要的反清復明之地。清軍入閩，沿海遷界，私家藏書，抄毀焚掠，慘遭厄運，損失殆盡。康熙統一臺灣之后，福建恢復元氣，尤其是雍正以降，隨著政治與社會的日趨穩定，經濟發達，文化繁榮，福建私家藏書又迅猛發展起來。這一時期的藏書家主要集中在福州、莆田及泉州等地。例如：晉江黃虞稷在其父兄的遺藏基礎上，不遺余力地廣搜古今秘本珍籍，遂使藏書之數，很快增至8萬余卷，且易其父黃居中的“千頃齋”為聞名全國的“千頃堂”藏書樓。安溪的李光地、晉江的蔡仕舢與徐居敬等人的藏書，亦負有盛名。福州的藏書家群體則更為龐大，尤為著名的有：林佶的“樸學齋”藏書7萬余卷、蕭夢松的“名山草堂”藏書8萬余卷；還有陳夢雷與“松鶴山房”、李馥的“居業堂”等藏書，均名重一時，成就了福建私家藏書新的輝煌。
乾（隆）、嘉（慶）時期，福建更是藏書家輩出、藏書樓林立。此時，福州和閩南地區仍然是私家藏書云集之地，福州地區著名的藏書家與藏書樓主要有：黃任的“十硯軒”、謝道承的“春草堂”、何蔚然的“西郊草堂”、葉觀國的“綠筠書屋”、孟超然的“亦園亭”、鄭杰的“注韓居”、梁章鉅的“黃樓”、陳若霖的“居敬堂”、陳壽祺的“小嫏嬛館”、陳征芝的“帶經堂”、何則賢的“靜學書屋”等等；閩南地區的有如：張祥云的“鞠園”、陳慶鏞的“籀經堂”黃宗漢的“一六淵海”等等。此外，閩北、甚至閩西也出現了個別大藏書家，如著名的伊秉綬“留春草堂”等。這一時期，福建的私家藏書日臻頂峰。
道光以后至清末，福建私家藏書在保持了一段鼎盛后，開始了逐步式微。其間，福州地區著名的藏書家與藏書樓主要有：林則徐的“云左山房”與“七十二峰樓”、李彥彬的“榕亭”、李彥章的“榕園”、林鴻年的“松風仙館”、何則賢的“靜學書屋”、郭柏蒼的“沁泉山館”、謝章鋌的“賭棋山莊”、林壽圖的“歐齋”、楊浚的“冠悔堂”、葉大莊的“玉屏山莊”、鄭孝胥的“海藏樓”等，尤值一提的是，清末福州還有兩大藏書家格外耀眼，即福州北后街龔易圖的“大通樓”和福州南郊螺洲鎮陳寶琛的“賜書樓、還讀樓、滄趣樓、北望樓、晞樓”等“藏書五樓”，這兩座著名藏書樓交相輝映，時有“南陳北龔”之稱。龔、陳二氏，世代藏書，不僅數量多，且不乏珍本秘籍。陳氏的10余萬卷藏書，更有“清末甲于全閩”之譽，其“賜書樓”所藏，多為清帝所賜，彌足珍貴。民國以后，陳寶琛有感于善藏書者，“不藏于私而藏于公”，遂首開福州私家藏書大量捐贈圖書館之風氣，得了福州其他藏書家的積極響應與社會的普遍贊賞。此外，閩南地區陳棨仁的“綰綽堂”與“讀我書齋”、龔顯曾的“薇花吟館” 與“亦園”，閩北地區李枝青的“讀騷山房”、吳壽坤的“讀我書室”等等，亦是頗具聲名的藏書家與藏書樓。
清代福建私家藏書事業的鼎盛，大大促進了福建私家藏書目的發展。有文獻記載的，清代福建私家藏書編有目錄的就多過二三十家，比較著名的有黃虞稷《千頃堂書目》、鄭杰《注韓居書目》、陳征芝《帶經堂書目》、林則徐《云左山房藏書目》、陳喬縱《陳樸園藏書目錄》、謝章鋌《賭棋山莊藏書目錄》、楊浚《冠悔堂書目》、陳棨仁《讀我書齋藏書書目》、龔易圖《烏石山房藏書簡明目錄》、《大通樓藏書目錄》、陳寶琛《閩縣螺陳氏賜書樓書目》等。他們將自己收藏的典籍一一著錄，目錄多按“經、史、子、集”四部分類，著錄了所藏書名、卷數、作者、版本、卷數等，有的還敘及書的內容，品評鑒賞、論其得失。從這些藏書目錄中，我們不僅可以窺見當時福建藏書家的藏書規模、特色，而且還可以進一步了解藏書家的藏書心態與藏書文化等。然而，遺憾的是，不少清代福建私家藏書目現已散佚，如何蔚然《飲和樓藏書目》、《寶唐樓藏書目》，龔顯曾《薇花吟館書目》等，令人嘆惜！
清代福建藏書家大都不是為了藏書而藏書，他們主張藏以致用，把藏書同自己的學術研究結合起來，在校勘、輯佚以及經學、史學、文學等領域的研究，成就斐然，為清代學術的繁榮與發展作出了重要的貢獻。如：黃虞稷、李光地、陳夢雷、鄭杰、梁章鉅、陳壽祺、林則徐、林鴻年、謝章鋌、楊浚等等，既都是藏書大家，又是著述等身的大學問家，他們的藏書活動，大大促進了福建傳統學術文化的發展，營造了深厚博雅的人文氛圍，致使近代以來，與全國其他地區相比，福建人才尤為輩出，其間的內在關聯，值得我們繼續探討。
總而言之，雖然目前福建的清代私家藏書樓，歷經百年風雨滄桑，大都蕩然無存，有的連故址遺跡都難以探尋，但是由清代福建藏書家不遺余力、網羅叢殘、精心保管、世代遞藏的珍本秘籍，民國以后又以各種方式歸入公共圖書館或高校圖書館，成為現在福建各大圖書館的珍貴館藏的核心部分，既承傳了福建傳統文化，又服務于當今的社會各界，其學術文化功績和社會歷史貢獻，已銘刻于八閩史冊。
