到了翁同龢那里，他就沒有張之洞和潘鼎新那么高尚的私德，處處和李鴻章針鋒相對，而北洋海軍則成為了攻擊重點。同時，翁作為清流派領袖，發動清流派處處和李鴻章為難。哪怕是國難臨頭，翁師傅仍然不放棄給李鴻章下絆子。北洋海軍的覆沒，有一點原因就是裝備跟不上去。

這倒怪不得李鴻章等人喊冤，北洋水師從1883年到1895年十多年時間里，沒有購買一艘新軍艦，更別說升級現有軍艦武器系統了，“吉野”等日本軍艦裝配的是英國阿姆斯特朗公司生產的6寸40倍口徑速射炮，而“定遠”等北洋軍艦裝備的是德國克虜伯305mm后膛炮。

若翁同酥敢于公開以私廢公，扣押北洋水師的軍費，且不說給清流們提供了一個大題材，就是李鴻章本人，又會放過翁同酥嗎？答案是非常明顯的，大家都不傻。所以朝廷確實停 撥了很多北洋水師的軍費，但在輿論方面，卻是安靜得很，因為這是大局所限，套不上公報私仇。

翁同龢的哥哥翁同書擔任安徽巡撫的時候鎮壓太平軍時出了岔子，曾國藩彈劾他，彈劾的奏章是李鴻章寫的，結果是翁同書被朝廷判了死緩而后又發配新疆。翁同書雖有過失但主要是因為反復無常的苗沛霖替朝廷和勝保當了替罪羊，而朝廷為了拉攏曾國藩犧牲了翁同書 。